Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GTF2BQ00403 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GTF2BQ00403 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms