Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TFAMQ00059 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TFAMQ00059 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms