Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SMAD3P84022 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMAD3P84022 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms