Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IRX1P78414 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRX1P78414 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRX1P78414 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRX1P78414 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRX1P78414 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRX1P78414 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRX1P78414 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRX1P78414 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRX1P78414 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRX1P78414 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRX1P78414 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRX1P78414 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRX1P78414 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRX1P78414 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRX1P78414 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IRX1P78414 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX1P78414 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX1P78414 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX1P78414 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX1P78414 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX1P78414 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX1P78414 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX1P78414 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX1P78414 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX1P78414 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX1P78414 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX1P78414 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX1P78414 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX1P78414 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX1P78414 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX1P78414 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IRX1P78414 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX1P78414 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX1P78414 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX1P78414 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX1P78414 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX1P78414 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX1P78414 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX1P78414 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX1P78414 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX1P78414 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX1P78414 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX1P78414 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX1P78414 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX1P78414 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX1P78414 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX1P78414 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX1P78414 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX1P78414 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX1P78414 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX1P78414 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IRX1P78414 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX1P78414 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX1P78414 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX1P78414 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX1P78414 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX1P78414 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX1P78414 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX1P78414 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX1P78414 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX1P78414 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX1P78414 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX1P78414 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX1P78414 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX1P78414 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IRX1P78414 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
IRX1P78414 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.82
IRX1P78414 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IRX1P78414 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IRX1P78414 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX1P78414 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX1P78414 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX1P78414 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX1P78414 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX1P78414 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX1P78414 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX1P78414 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX1P78414 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX1P78414 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX1P78414 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX1P78414 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX1P78414 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX1P78414 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX1P78414 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX1P78414 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX1P78414 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IRX1P78414 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX1P78414 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX1P78414 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX1P78414 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX1P78414 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX1P78414 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX1P78414 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX1P78414 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX1P78414 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX1P78414 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX1P78414 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX1P78414 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IRX1P78414 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms