Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX5P78411 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX5P78411 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX5P78411 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX5P78411 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX5P78411 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX5P78411 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX5P78411 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX5P78411 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX5P78411 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX5P78411 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX5P78411 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX5P78411 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX5P78411 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX5P78411 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX5P78411 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX5P78411 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX5P78411 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX5P78411 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX5P78411 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX5P78411 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX5P78411 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX5P78411 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX5P78411 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX5P78411 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX5P78411 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX5P78411 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX5P78411 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX5P78411 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX5P78411 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX5P78411 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX5P78411 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX5P78411 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX5P78411 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX5P78411 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX5P78411 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX5P78411 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX5P78411 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX5P78411 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX5P78411 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX5P78411 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX5P78411 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX5P78411 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX5P78411 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX5P78411 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX5P78411 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX5P78411 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX5P78411 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX5P78411 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX5P78411 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX5P78411 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX5P78411 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX5P78411 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX5P78411 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX5P78411 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX5P78411 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX5P78411 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX5P78411 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX5P78411 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX5P78411 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX5P78411 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX5P78411 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX5P78411 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX5P78411 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX5P78411 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX5P78411 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX5P78411 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX5P78411 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX5P78411 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX5P78411 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX5P78411 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX5P78411 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX5P78411 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX5P78411 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX5P78411 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX5P78411 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX5P78411 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX5P78411 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX5P78411 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX5P78411 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX5P78411 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX5P78411 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX5P78411 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX5P78411 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX5P78411 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX5P78411 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX5P78411 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX5P78411 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX5P78411 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX5P78411 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX5P78411 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX5P78411 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX5P78411 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX5P78411 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX5P78411 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX5P78411 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX5P78411 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX5P78411 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX5P78411 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRX5P78411 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms