Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CLDN10P78369 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CLDN10P78369 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms