Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CSNK2A1P68400 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms