Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SKP1P63208 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SKP1P63208 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKP1P63208 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKP1P63208 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKP1P63208 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SKP1P63208 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
SKP1P63208 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKP1P63208 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKP1P63208 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKP1P63208 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKP1P63208 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SKP1P63208 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKP1P63208 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKP1P63208 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKP1P63208 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKP1P63208 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKP1P63208 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKP1P63208 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKP1P63208 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKP1P63208 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SKP1P63208 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP1P63208 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP1P63208 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP1P63208 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP1P63208 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP1P63208 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP1P63208 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP1P63208 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP1P63208 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP1P63208 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP1P63208 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP1P63208 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP1P63208 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP1P63208 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP1P63208 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP1P63208 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP1P63208 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP1P63208 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SKP1P63208 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP1P63208 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP1P63208 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP1P63208 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP1P63208 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP1P63208 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP1P63208 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP1P63208 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP1P63208 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP1P63208 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP1P63208 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP1P63208 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP1P63208 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP1P63208 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP1P63208 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP1P63208 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP1P63208 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP1P63208 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP1P63208 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP1P63208 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP1P63208 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP1P63208 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP1P63208 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SKP1P63208 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP1P63208 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP1P63208 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP1P63208 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP1P63208 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP1P63208 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP1P63208 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP1P63208 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP1P63208 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP1P63208 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP1P63208 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP1P63208 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP1P63208 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP1P63208 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP1P63208 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP1P63208 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP1P63208 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP1P63208 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP1P63208 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SKP1P63208 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP1P63208 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP1P63208 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP1P63208 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP1P63208 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP1P63208 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP1P63208 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP1P63208 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP1P63208 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP1P63208 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP1P63208 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP1P63208 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP1P63208 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP1P63208 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP1P63208 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP1P63208 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP1P63208 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP1P63208 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SKP1P63208 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms