Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HERVK_113P63132 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms