Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL11P62913 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL11P62913 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL11P62913 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL11P62913 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL11P62913 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL11P62913 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL11P62913 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL11P62913 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL11P62913 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL11P62913 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL11P62913 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL11P62913 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL11P62913 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL11P62913 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL11P62913 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL11P62913 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL11P62913 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPL11P62913 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL11P62913 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL11P62913 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL11P62913 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL11P62913 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL11P62913 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL11P62913 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL11P62913 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL11P62913 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL11P62913 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL11P62913 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL11P62913 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL11P62913 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL11P62913 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL11P62913 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL11P62913 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL11P62913 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL11P62913 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL11P62913 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL11P62913 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL11P62913 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL11P62913 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL11P62913 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL11P62913 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL11P62913 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL11P62913 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPL11P62913 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPL11P62913 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL11P62913 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL11P62913 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL11P62913 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL11P62913 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL11P62913 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL11P62913 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL11P62913 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL11P62913 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL11P62913 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL11P62913 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL11P62913 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL11P62913 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL11P62913 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL11P62913 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL11P62913 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL11P62913 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL11P62913 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL11P62913 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL11P62913 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL11P62913 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL11P62913 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL11P62913 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL11P62913 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL11P62913 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPL11P62913 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms