Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOBP62745 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOBP62745 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOBP62745 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOBP62745 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOBP62745 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOBP62745 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOBP62745 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOBP62745 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOBP62745 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOBP62745 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOBP62745 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RHOBP62745 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOBP62745 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOBP62745 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOBP62745 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOBP62745 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOBP62745 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOBP62745 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOBP62745 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOBP62745 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOBP62745 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOBP62745 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOBP62745 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOBP62745 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOBP62745 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOBP62745 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOBP62745 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOBP62745 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOBP62745 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOBP62745 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOBP62745 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOBP62745 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOBP62745 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOBP62745 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RHOBP62745 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOBP62745 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOBP62745 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOBP62745 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOBP62745 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOBP62745 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOBP62745 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOBP62745 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOBP62745 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOBP62745 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOBP62745 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOBP62745 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOBP62745 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOBP62745 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOBP62745 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOBP62745 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOBP62745 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOBP62745 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOBP62745 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOBP62745 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOBP62745 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOBP62745 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOBP62745 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RHOBP62745 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOBP62745 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOBP62745 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOBP62745 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOBP62745 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOBP62745 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOBP62745 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOBP62745 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOBP62745 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOBP62745 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOBP62745 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOBP62745 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOBP62745 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOBP62745 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOBP62745 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RHOBP62745 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RHOBP62745 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RHOBP62745 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RHOBP62745 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOBP62745 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOBP62745 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOBP62745 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOBP62745 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOBP62745 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOBP62745 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOBP62745 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOBP62745 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOBP62745 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOBP62745 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOBP62745 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOBP62745 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOBP62745 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOBP62745 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOBP62745 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOBP62745 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOBP62745 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOBP62745 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOBP62745 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOBP62745 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHOBP62745 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOBP62745 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHOBP62745 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms