Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERVK-21P61565 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERVK-21P61565 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms