Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RIPPLY3P57055 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RIPPLY3P57055 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms