Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCKAP1LP55160 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCKAP1LP55160 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NCKAP1LP55160 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms