Protein–RNA interactions for Protein: P55145

MANF, Mesencephalic astrocyte-derived neurotrophic factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MANFP55145 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MANFP55145 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MANFP55145 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MANFP55145 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MANFP55145 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MANFP55145 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MANFP55145 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MANFP55145 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MANFP55145 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MANFP55145 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MANFP55145 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MANFP55145 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MANFP55145 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
MANFP55145 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MANFP55145 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MANFP55145 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
MANFP55145 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
MANFP55145 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MANFP55145 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MANFP55145 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MANFP55145 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MANFP55145 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MANFP55145 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MANFP55145 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MANFP55145 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MANFP55145 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MANFP55145 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MANFP55145 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MANFP55145 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MANFP55145 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MANFP55145 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
MANFP55145 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MANFP55145 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MANFP55145 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MANFP55145 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MANFP55145 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MANFP55145 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MANFP55145 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MANFP55145 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MANFP55145 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
MANFP55145 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
MANFP55145 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MANFP55145 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MANFP55145 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MANFP55145 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MANFP55145 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MANFP55145 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MANFP55145 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MANFP55145 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MANFP55145 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MANFP55145 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MANFP55145 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MANFP55145 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MANFP55145 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
MANFP55145 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
MANFP55145 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
MANFP55145 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MANFP55145 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MANFP55145 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MANFP55145 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MANFP55145 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MANFP55145 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MANFP55145 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MANFP55145 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MANFP55145 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MANFP55145 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MANFP55145 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MANFP55145 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MANFP55145 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MANFP55145 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MANFP55145 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MANFP55145 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MANFP55145 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MANFP55145 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MANFP55145 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MANFP55145 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MANFP55145 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MANFP55145 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
MANFP55145 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
MANFP55145 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MANFP55145 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MANFP55145 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MANFP55145 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MANFP55145 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MANFP55145 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MANFP55145 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MANFP55145 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MANFP55145 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MANFP55145 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MANFP55145 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MANFP55145 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MANFP55145 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MANFP55145 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MANFP55145 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MANFP55145 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MANFP55145 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MANFP55145 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
MANFP55145 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
MANFP55145 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
MANFP55145 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms