Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RAD23AP54725 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RAD23AP54725 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms