Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PRKAA2P54646 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRKAA2P54646 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms