Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
AP2S1P53680 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
AP2S1P53680 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP2S1P53680 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP2S1P53680 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP2S1P53680 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP2S1P53680 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
AP2S1P53680 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP2S1P53680 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP2S1P53680 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP2S1P53680 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP2S1P53680 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP2S1P53680 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP2S1P53680 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
AP2S1P53680 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP2S1P53680 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
AP2S1P53680 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP2S1P53680 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP2S1P53680 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP2S1P53680 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP2S1P53680 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP2S1P53680 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
AP2S1P53680 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AP2S1P53680 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms