Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP5P51878 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP5P51878 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP5P51878 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP5P51878 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP5P51878 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP5P51878 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP5P51878 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP5P51878 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP5P51878 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP5P51878 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP5P51878 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP5P51878 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP5P51878 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP5P51878 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP5P51878 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP5P51878 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP5P51878 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP5P51878 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP5P51878 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP5P51878 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP5P51878 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP5P51878 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP5P51878 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP5P51878 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP5P51878 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP5P51878 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP5P51878 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP5P51878 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CASP5P51878 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP5P51878 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP5P51878 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP5P51878 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP5P51878 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP5P51878 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP5P51878 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP5P51878 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP5P51878 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP5P51878 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP5P51878 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP5P51878 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP5P51878 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP5P51878 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP5P51878 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP5P51878 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP5P51878 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP5P51878 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP5P51878 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP5P51878 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP5P51878 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP5P51878 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP5P51878 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP5P51878 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP5P51878 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP5P51878 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP5P51878 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP5P51878 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP5P51878 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP5P51878 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP5P51878 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP5P51878 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP5P51878 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP5P51878 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP5P51878 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP5P51878 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP5P51878 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP5P51878 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP5P51878 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP5P51878 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP5P51878 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP5P51878 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP5P51878 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP5P51878 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP5P51878 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP5P51878 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP5P51878 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP5P51878 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP5P51878 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP5P51878 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP5P51878 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP5P51878 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP5P51878 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP5P51878 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP5P51878 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP5P51878 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP5P51878 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP5P51878 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP5P51878 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP5P51878 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP5P51878 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP5P51878 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP5P51878 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP5P51878 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP5P51878 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP5P51878 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP5P51878 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP5P51878 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP5P51878 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP5P51878 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP5P51878 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms