Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPC3P51654 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GPC3P51654 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC3P51654 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC3P51654 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC3P51654 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC3P51654 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC3P51654 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC3P51654 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC3P51654 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC3P51654 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC3P51654 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC3P51654 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC3P51654 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC3P51654 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC3P51654 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC3P51654 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC3P51654 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC3P51654 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC3P51654 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC3P51654 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPC3P51654 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC3P51654 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC3P51654 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC3P51654 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC3P51654 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC3P51654 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC3P51654 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC3P51654 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC3P51654 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC3P51654 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC3P51654 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC3P51654 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC3P51654 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC3P51654 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC3P51654 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC3P51654 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPC3P51654 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC3P51654 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC3P51654 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC3P51654 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC3P51654 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC3P51654 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC3P51654 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC3P51654 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC3P51654 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC3P51654 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC3P51654 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC3P51654 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC3P51654 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC3P51654 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC3P51654 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPC3P51654 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC3P51654 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC3P51654 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC3P51654 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC3P51654 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC3P51654 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC3P51654 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC3P51654 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC3P51654 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC3P51654 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC3P51654 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC3P51654 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC3P51654 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC3P51654 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPC3P51654 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC3P51654 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC3P51654 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC3P51654 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC3P51654 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC3P51654 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC3P51654 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC3P51654 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC3P51654 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC3P51654 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC3P51654 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC3P51654 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC3P51654 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC3P51654 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC3P51654 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC3P51654 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC3P51654 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC3P51654 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPC3P51654 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC3P51654 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC3P51654 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC3P51654 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC3P51654 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC3P51654 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPC3P51654 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GPC3P51654 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC3P51654 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC3P51654 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC3P51654 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC3P51654 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC3P51654 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC3P51654 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC3P51654 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPC3P51654 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms