Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ETV1P50549 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETV1P50549 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETV1P50549 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETV1P50549 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETV1P50549 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETV1P50549 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETV1P50549 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETV1P50549 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETV1P50549 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ETV1P50549 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETV1P50549 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ETV1P50549 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETV1P50549 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ETV1P50549 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETV1P50549 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETV1P50549 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETV1P50549 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETV1P50549 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETV1P50549 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETV1P50549 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETV1P50549 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETV1P50549 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ETV1P50549 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ETV1P50549 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETV1P50549 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETV1P50549 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETV1P50549 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ETV1P50549 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETV1P50549 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETV1P50549 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETV1P50549 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETV1P50549 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETV1P50549 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETV1P50549 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETV1P50549 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETV1P50549 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETV1P50549 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETV1P50549 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETV1P50549 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETV1P50549 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETV1P50549 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETV1P50549 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETV1P50549 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ETV1P50549 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETV1P50549 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETV1P50549 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETV1P50549 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ETV1P50549 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ETV1P50549 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ETV1P50549 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ETV1P50549 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ETV1P50549 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ETV1P50549 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ETV1P50549 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ETV1P50549 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ETV1P50549 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ETV1P50549 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ETV1P50549 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ETV1P50549 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ETV1P50549 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ETV1P50549 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ETV1P50549 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ETV1P50549 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ETV1P50549 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ETV1P50549 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ETV1P50549 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ETV1P50549 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ETV1P50549 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ETV1P50549 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ETV1P50549 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ETV1P50549 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ETV1P50549 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ETV1P50549 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ETV1P50549 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ETV1P50549 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ETV1P50549 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ETV1P50549 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ETV1P50549 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ETV1P50549 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ETV1P50549 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ETV1P50549 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ETV1P50549 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ETV1P50549 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ETV1P50549 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ETV1P50549 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ETV1P50549 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ETV1P50549 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ETV1P50549 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ETV1P50549 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ETV1P50549 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ETV1P50549 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ETV1P50549 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ETV1P50549 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ETV1P50549 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ETV1P50549 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ETV1P50549 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ETV1P50549 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ETV1P50549 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ETV1P50549 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms