Protein–RNA interactions for Protein: P49788

RARRES1, Retinoic acid receptor responder protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1P49788 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RARRES1P49788 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RARRES1P49788 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms