Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRCC3P46736 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRCC3P46736 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms