Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GRIA2P42262 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms