Protein–RNA interactions for Protein: P40937

RFC5, Replication factor C subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC5P40937 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC5P40937 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC5P40937 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC5P40937 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC5P40937 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC5P40937 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC5P40937 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC5P40937 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC5P40937 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC5P40937 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC5P40937 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC5P40937 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC5P40937 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC5P40937 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC5P40937 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC5P40937 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC5P40937 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC5P40937 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC5P40937 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC5P40937 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC5P40937 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC5P40937 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC5P40937 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC5P40937 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC5P40937 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC5P40937 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC5P40937 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC5P40937 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC5P40937 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC5P40937 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC5P40937 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFC5P40937 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC5P40937 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC5P40937 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC5P40937 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC5P40937 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC5P40937 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC5P40937 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC5P40937 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC5P40937 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC5P40937 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC5P40937 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC5P40937 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC5P40937 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC5P40937 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC5P40937 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC5P40937 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC5P40937 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC5P40937 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC5P40937 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC5P40937 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC5P40937 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC5P40937 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC5P40937 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC5P40937 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC5P40937 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFC5P40937 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC5P40937 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC5P40937 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC5P40937 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC5P40937 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC5P40937 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC5P40937 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC5P40937 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC5P40937 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC5P40937 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC5P40937 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC5P40937 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC5P40937 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC5P40937 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC5P40937 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC5P40937 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC5P40937 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFC5P40937 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC5P40937 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC5P40937 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC5P40937 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC5P40937 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC5P40937 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC5P40937 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC5P40937 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC5P40937 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC5P40937 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC5P40937 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC5P40937 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC5P40937 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC5P40937 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC5P40937 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC5P40937 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC5P40937 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC5P40937 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC5P40937 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC5P40937 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC5P40937 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC5P40937 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC5P40937 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC5P40937 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFC5P40937 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC5P40937 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFC5P40937 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms