Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THPOP40225 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THPOP40225 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THPOP40225 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
THPOP40225 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THPOP40225 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
THPOP40225 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THPOP40225 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THPOP40225 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
THPOP40225 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
THPOP40225 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
THPOP40225 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
THPOP40225 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THPOP40225 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THPOP40225 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THPOP40225 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THPOP40225 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THPOP40225 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THPOP40225 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THPOP40225 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THPOP40225 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THPOP40225 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THPOP40225 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THPOP40225 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
THPOP40225 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
THPOP40225 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THPOP40225 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THPOP40225 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THPOP40225 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THPOP40225 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THPOP40225 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THPOP40225 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
THPOP40225 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THPOP40225 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THPOP40225 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THPOP40225 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THPOP40225 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THPOP40225 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THPOP40225 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
THPOP40225 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THPOP40225 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
THPOP40225 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
THPOP40225 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THPOP40225 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THPOP40225 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THPOP40225 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THPOP40225 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THPOP40225 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THPOP40225 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THPOP40225 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THPOP40225 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THPOP40225 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THPOP40225 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
THPOP40225 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
THPOP40225 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THPOP40225 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THPOP40225 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THPOP40225 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THPOP40225 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THPOP40225 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THPOP40225 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THPOP40225 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THPOP40225 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THPOP40225 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THPOP40225 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THPOP40225 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THPOP40225 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THPOP40225 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THPOP40225 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
THPOP40225 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
THPOP40225 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THPOP40225 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THPOP40225 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
THPOP40225 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THPOP40225 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THPOP40225 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THPOP40225 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THPOP40225 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
THPOP40225 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
THPOP40225 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THPOP40225 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
THPOP40225 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THPOP40225 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THPOP40225 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THPOP40225 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THPOP40225 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
THPOP40225 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THPOP40225 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THPOP40225 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
THPOP40225 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THPOP40225 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THPOP40225 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THPOP40225 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THPOP40225 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THPOP40225 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THPOP40225 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THPOP40225 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THPOP40225 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
THPOP40225 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
THPOP40225 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms