Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP62P37198 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUP62P37198 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP62P37198 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP62P37198 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP62P37198 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP62P37198 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP62P37198 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP62P37198 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP62P37198 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP62P37198 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP62P37198 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP62P37198 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP62P37198 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP62P37198 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP62P37198 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP62P37198 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP62P37198 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP62P37198 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP62P37198 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP62P37198 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP62P37198 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP62P37198 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUP62P37198 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP62P37198 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP62P37198 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP62P37198 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP62P37198 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP62P37198 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP62P37198 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP62P37198 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP62P37198 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP62P37198 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP62P37198 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP62P37198 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP62P37198 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP62P37198 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP62P37198 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP62P37198 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP62P37198 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP62P37198 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP62P37198 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP62P37198 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP62P37198 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP62P37198 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP62P37198 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP62P37198 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUP62P37198 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP62P37198 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP62P37198 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP62P37198 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP62P37198 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP62P37198 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP62P37198 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP62P37198 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP62P37198 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP62P37198 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP62P37198 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP62P37198 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP62P37198 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP62P37198 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP62P37198 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP62P37198 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP62P37198 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP62P37198 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP62P37198 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP62P37198 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP62P37198 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP62P37198 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP62P37198 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUP62P37198 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NUP62P37198 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NUP62P37198 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NUP62P37198 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NUP62P37198 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP62P37198 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP62P37198 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP62P37198 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP62P37198 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP62P37198 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP62P37198 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP62P37198 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP62P37198 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP62P37198 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP62P37198 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP62P37198 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP62P37198 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP62P37198 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP62P37198 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP62P37198 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP62P37198 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP62P37198 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUP62P37198 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP62P37198 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP62P37198 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP62P37198 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP62P37198 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP62P37198 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP62P37198 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUP62P37198 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms