Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBRP36941 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBRP36941 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBRP36941 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBRP36941 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBRP36941 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBRP36941 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBRP36941 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBRP36941 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LTBRP36941 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTBRP36941 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTBRP36941 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTBRP36941 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTBRP36941 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTBRP36941 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LTBRP36941 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBRP36941 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBRP36941 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBRP36941 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBRP36941 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBRP36941 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBRP36941 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBRP36941 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBRP36941 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBRP36941 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBRP36941 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBRP36941 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBRP36941 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBRP36941 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBRP36941 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBRP36941 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBRP36941 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBRP36941 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBRP36941 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LTBRP36941 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBRP36941 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBRP36941 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBRP36941 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBRP36941 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBRP36941 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBRP36941 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBRP36941 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBRP36941 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LTBRP36941 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBRP36941 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBRP36941 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBRP36941 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBRP36941 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBRP36941 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBRP36941 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBRP36941 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBRP36941 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBRP36941 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBRP36941 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBRP36941 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBRP36941 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBRP36941 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBRP36941 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBRP36941 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBRP36941 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBRP36941 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBRP36941 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBRP36941 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBRP36941 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LTBRP36941 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBRP36941 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBRP36941 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBRP36941 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBRP36941 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBRP36941 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBRP36941 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBRP36941 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBRP36941 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBRP36941 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBRP36941 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBRP36941 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBRP36941 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBRP36941 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBRP36941 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBRP36941 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LTBRP36941 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBRP36941 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBRP36941 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBRP36941 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBRP36941 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBRP36941 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBRP36941 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBRP36941 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBRP36941 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBRP36941 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBRP36941 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBRP36941 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBRP36941 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBRP36941 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBRP36941 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LTBRP36941 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBRP36941 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBRP36941 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBRP36941 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LTBRP36941 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms