Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ATP6V1E1P36543 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ATP6V1E1P36543 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms