Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRIM23P36406 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRIM23P36406 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms