Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FLT4P35916 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
FLT4P35916 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FLT4P35916 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
FLT4P35916 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FLT4P35916 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
FLT4P35916 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
FLT4P35916 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.54■■■□□ 2
FLT4P35916 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FLT4P35916 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FLT4P35916 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FLT4P35916 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FLT4P35916 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FLT4P35916 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FLT4P35916 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FLT4P35916 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FLT4P35916 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FLT4P35916 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FLT4P35916 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FLT4P35916 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
FLT4P35916 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FLT4P35916 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FLT4P35916 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FLT4P35916 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FLT4P35916 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FLT4P35916 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
FLT4P35916 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FLT4P35916 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FLT4P35916 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FLT4P35916 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FLT4P35916 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FLT4P35916 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FLT4P35916 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FLT4P35916 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FLT4P35916 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FLT4P35916 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FLT4P35916 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
FLT4P35916 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FLT4P35916 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FLT4P35916 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FLT4P35916 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FLT4P35916 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FLT4P35916 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FLT4P35916 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FLT4P35916 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FLT4P35916 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FLT4P35916 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FLT4P35916 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FLT4P35916 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FLT4P35916 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FLT4P35916 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FLT4P35916 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FLT4P35916 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FLT4P35916 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FLT4P35916 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FLT4P35916 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FLT4P35916 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FLT4P35916 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FLT4P35916 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FLT4P35916 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FLT4P35916 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FLT4P35916 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FLT4P35916 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FLT4P35916 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FLT4P35916 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FLT4P35916 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FLT4P35916 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FLT4P35916 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FLT4P35916 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FLT4P35916 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FLT4P35916 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
FLT4P35916 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FLT4P35916 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FLT4P35916 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FLT4P35916 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FLT4P35916 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FLT4P35916 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FLT4P35916 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FLT4P35916 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FLT4P35916 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FLT4P35916 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FLT4P35916 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FLT4P35916 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FLT4P35916 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FLT4P35916 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FLT4P35916 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FLT4P35916 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FLT4P35916 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FLT4P35916 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FLT4P35916 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FLT4P35916 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FLT4P35916 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FLT4P35916 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FLT4P35916 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FLT4P35916 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FLT4P35916 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FLT4P35916 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FLT4P35916 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FLT4P35916 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FLT4P35916 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms