Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYLC1P35663 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms