Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCN4AP35499 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN4AP35499 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
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