Protein–RNA interactions for Protein: P32780

GTF2H1, General transcription factor IIH subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H1P32780 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GTF2H1P32780 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2H1P32780 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms