Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND2P30279 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND2P30279 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND2P30279 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND2P30279 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND2P30279 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND2P30279 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND2P30279 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND2P30279 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND2P30279 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND2P30279 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND2P30279 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CCND2P30279 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCND2P30279 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCND2P30279 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCND2P30279 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCND2P30279 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCND2P30279 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCND2P30279 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCND2P30279 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCND2P30279 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND2P30279 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND2P30279 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND2P30279 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND2P30279 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND2P30279 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND2P30279 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND2P30279 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND2P30279 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND2P30279 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCND2P30279 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND2P30279 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND2P30279 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND2P30279 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND2P30279 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND2P30279 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND2P30279 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND2P30279 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND2P30279 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND2P30279 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND2P30279 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND2P30279 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND2P30279 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND2P30279 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND2P30279 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCND2P30279 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND2P30279 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND2P30279 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND2P30279 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND2P30279 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND2P30279 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND2P30279 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND2P30279 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCND2P30279 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND2P30279 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND2P30279 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND2P30279 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND2P30279 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND2P30279 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND2P30279 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND2P30279 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND2P30279 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND2P30279 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND2P30279 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND2P30279 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND2P30279 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND2P30279 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND2P30279 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND2P30279 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND2P30279 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND2P30279 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND2P30279 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND2P30279 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND2P30279 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND2P30279 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND2P30279 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND2P30279 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCND2P30279 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND2P30279 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND2P30279 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND2P30279 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND2P30279 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND2P30279 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND2P30279 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND2P30279 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND2P30279 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND2P30279 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND2P30279 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND2P30279 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND2P30279 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND2P30279 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND2P30279 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND2P30279 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND2P30279 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND2P30279 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND2P30279 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND2P30279 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCND2P30279 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCND2P30279 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCND2P30279 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms