Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
KDM5AP29375 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
KDM5AP29375 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
KDM5AP29375 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms