Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GJB2P29033 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GJB2P29033 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GJB2P29033 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GJB2P29033 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GJB2P29033 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB2P29033 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB2P29033 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB2P29033 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB2P29033 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB2P29033 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB2P29033 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB2P29033 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB2P29033 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB2P29033 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB2P29033 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB2P29033 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB2P29033 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB2P29033 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB2P29033 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB2P29033 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB2P29033 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJB2P29033 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB2P29033 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB2P29033 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB2P29033 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB2P29033 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB2P29033 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB2P29033 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB2P29033 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB2P29033 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB2P29033 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB2P29033 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB2P29033 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB2P29033 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB2P29033 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB2P29033 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB2P29033 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB2P29033 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB2P29033 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB2P29033 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJB2P29033 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB2P29033 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB2P29033 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB2P29033 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB2P29033 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB2P29033 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB2P29033 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB2P29033 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB2P29033 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB2P29033 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB2P29033 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJB2P29033 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB2P29033 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB2P29033 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB2P29033 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB2P29033 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB2P29033 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB2P29033 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB2P29033 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB2P29033 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB2P29033 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB2P29033 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB2P29033 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB2P29033 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB2P29033 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB2P29033 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJB2P29033 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB2P29033 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB2P29033 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB2P29033 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB2P29033 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB2P29033 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB2P29033 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB2P29033 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB2P29033 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB2P29033 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB2P29033 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB2P29033 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GJB2P29033 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB2P29033 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB2P29033 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB2P29033 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB2P29033 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB2P29033 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB2P29033 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB2P29033 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB2P29033 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB2P29033 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB2P29033 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB2P29033 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB2P29033 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB2P29033 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB2P29033 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB2P29033 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB2P29033 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB2P29033 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB2P29033 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB2P29033 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GJB2P29033 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms