Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GCAP28676 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GCAP28676 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GCAP28676 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
GCAP28676 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GCAP28676 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GCAP28676 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GCAP28676 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GCAP28676 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GCAP28676 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GCAP28676 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GCAP28676 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GCAP28676 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GCAP28676 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GCAP28676 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GCAP28676 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GCAP28676 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GCAP28676 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GCAP28676 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GCAP28676 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GCAP28676 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GCAP28676 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GCAP28676 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GCAP28676 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GCAP28676 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GCAP28676 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GCAP28676 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GCAP28676 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GCAP28676 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GCAP28676 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GCAP28676 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GCAP28676 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GCAP28676 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GCAP28676 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GCAP28676 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GCAP28676 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GCAP28676 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GCAP28676 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GCAP28676 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GCAP28676 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GCAP28676 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GCAP28676 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GCAP28676 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GCAP28676 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GCAP28676 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GCAP28676 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GCAP28676 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GCAP28676 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GCAP28676 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GCAP28676 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GCAP28676 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GCAP28676 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GCAP28676 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GCAP28676 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
GCAP28676 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GCAP28676 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GCAP28676 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
GCAP28676 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
GCAP28676 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GCAP28676 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GCAP28676 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GCAP28676 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GCAP28676 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GCAP28676 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GCAP28676 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GCAP28676 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GCAP28676 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GCAP28676 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GCAP28676 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GCAP28676 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GCAP28676 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GCAP28676 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GCAP28676 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GCAP28676 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GCAP28676 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GCAP28676 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GCAP28676 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GCAP28676 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GCAP28676 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCAP28676 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCAP28676 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCAP28676 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCAP28676 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCAP28676 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCAP28676 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCAP28676 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCAP28676 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCAP28676 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCAP28676 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
GCAP28676 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCAP28676 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCAP28676 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCAP28676 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCAP28676 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCAP28676 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCAP28676 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCAP28676 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCAP28676 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCAP28676 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GCAP28676 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms