Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMLP26374 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMLP26374 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMLP26374 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMLP26374 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMLP26374 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMLP26374 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMLP26374 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMLP26374 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMLP26374 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMLP26374 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMLP26374 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMLP26374 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CHMLP26374 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMLP26374 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMLP26374 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMLP26374 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMLP26374 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMLP26374 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMLP26374 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMLP26374 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMLP26374 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMLP26374 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMLP26374 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMLP26374 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMLP26374 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMLP26374 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CHMLP26374 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMLP26374 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMLP26374 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMLP26374 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMLP26374 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMLP26374 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMLP26374 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMLP26374 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMLP26374 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMLP26374 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMLP26374 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMLP26374 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMLP26374 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMLP26374 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMLP26374 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMLP26374 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMLP26374 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CHMLP26374 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMLP26374 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMLP26374 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMLP26374 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMLP26374 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMLP26374 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMLP26374 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMLP26374 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMLP26374 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMLP26374 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMLP26374 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CHMLP26374 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMLP26374 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMLP26374 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMLP26374 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMLP26374 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMLP26374 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMLP26374 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMLP26374 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CHMLP26374 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHMLP26374 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHMLP26374 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHMLP26374 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHMLP26374 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHMLP26374 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CHMLP26374 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMLP26374 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMLP26374 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMLP26374 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMLP26374 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMLP26374 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMLP26374 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMLP26374 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMLP26374 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMLP26374 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMLP26374 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMLP26374 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMLP26374 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMLP26374 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMLP26374 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMLP26374 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMLP26374 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMLP26374 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMLP26374 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMLP26374 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CHMLP26374 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMLP26374 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMLP26374 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMLP26374 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMLP26374 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMLP26374 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMLP26374 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMLP26374 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMLP26374 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMLP26374 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHMLP26374 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms