Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LAMA1P25391 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
LAMA1P25391 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms