Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRDP23468 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRDP23468 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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