Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCP2P22307 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCP2P22307 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCP2P22307 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCP2P22307 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCP2P22307 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCP2P22307 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCP2P22307 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCP2P22307 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCP2P22307 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCP2P22307 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCP2P22307 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCP2P22307 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCP2P22307 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCP2P22307 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCP2P22307 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCP2P22307 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCP2P22307 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCP2P22307 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCP2P22307 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCP2P22307 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCP2P22307 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCP2P22307 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCP2P22307 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCP2P22307 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCP2P22307 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCP2P22307 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCP2P22307 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCP2P22307 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SCP2P22307 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCP2P22307 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCP2P22307 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCP2P22307 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCP2P22307 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCP2P22307 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCP2P22307 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCP2P22307 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCP2P22307 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCP2P22307 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCP2P22307 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCP2P22307 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCP2P22307 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCP2P22307 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCP2P22307 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SCP2P22307 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SCP2P22307 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCP2P22307 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCP2P22307 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCP2P22307 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCP2P22307 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCP2P22307 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCP2P22307 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCP2P22307 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCP2P22307 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCP2P22307 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCP2P22307 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCP2P22307 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCP2P22307 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCP2P22307 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCP2P22307 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCP2P22307 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCP2P22307 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCP2P22307 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCP2P22307 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCP2P22307 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCP2P22307 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCP2P22307 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCP2P22307 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCP2P22307 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCP2P22307 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCP2P22307 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCP2P22307 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCP2P22307 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCP2P22307 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCP2P22307 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCP2P22307 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCP2P22307 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCP2P22307 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCP2P22307 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCP2P22307 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCP2P22307 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCP2P22307 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCP2P22307 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCP2P22307 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCP2P22307 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCP2P22307 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCP2P22307 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCP2P22307 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCP2P22307 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCP2P22307 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCP2P22307 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCP2P22307 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCP2P22307 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCP2P22307 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCP2P22307 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCP2P22307 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCP2P22307 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCP2P22307 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCP2P22307 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCP2P22307 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227.2 ms