Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1P21675 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1P21675 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1P21675 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1P21675 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1P21675 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1P21675 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF1P21675 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1P21675 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1P21675 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1P21675 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1P21675 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1P21675 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1P21675 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1P21675 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1P21675 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1P21675 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1P21675 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1P21675 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1P21675 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1P21675 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1P21675 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF1P21675 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1P21675 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1P21675 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1P21675 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1P21675 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1P21675 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1P21675 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1P21675 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1P21675 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1P21675 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1P21675 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1P21675 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1P21675 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1P21675 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1P21675 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1P21675 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1P21675 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1P21675 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1P21675 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1P21675 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF1P21675 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1P21675 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1P21675 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1P21675 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1P21675 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1P21675 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1P21675 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1P21675 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1P21675 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1P21675 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1P21675 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1P21675 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF1P21675 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TAF1P21675 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TAF1P21675 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TAF1P21675 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TAF1P21675 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TAF1P21675 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TAF1P21675 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1P21675 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1P21675 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1P21675 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1P21675 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1P21675 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1P21675 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1P21675 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1P21675 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1P21675 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF1P21675 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1P21675 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1P21675 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1P21675 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1P21675 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1P21675 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1P21675 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1P21675 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1P21675 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1P21675 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1P21675 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF1P21675 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1P21675 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1P21675 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1P21675 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1P21675 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1P21675 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1P21675 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1P21675 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1P21675 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1P21675 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1P21675 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1P21675 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1P21675 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1P21675 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1P21675 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1P21675 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1P21675 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF1P21675 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF1P21675 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms