Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTNP21246 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTNP21246 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTNP21246 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTNP21246 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTNP21246 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTNP21246 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTNP21246 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTNP21246 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTNP21246 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTNP21246 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTNP21246 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTNP21246 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTNP21246 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTNP21246 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTNP21246 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTNP21246 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTNP21246 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTNP21246 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTNP21246 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTNP21246 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTNP21246 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTNP21246 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTNP21246 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTNP21246 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTNP21246 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTNP21246 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTNP21246 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTNP21246 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTNP21246 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTNP21246 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTNP21246 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTNP21246 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTNP21246 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTNP21246 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTNP21246 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTNP21246 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTNP21246 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTNP21246 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTNP21246 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTNP21246 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTNP21246 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTNP21246 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTNP21246 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTNP21246 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTNP21246 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTNP21246 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTNP21246 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTNP21246 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTNP21246 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTNP21246 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTNP21246 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTNP21246 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTNP21246 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTNP21246 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTNP21246 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTNP21246 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTNP21246 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTNP21246 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTNP21246 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTNP21246 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTNP21246 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTNP21246 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTNP21246 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTNP21246 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTNP21246 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTNP21246 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTNP21246 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTNP21246 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTNP21246 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTNP21246 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTNP21246 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTNP21246 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTNP21246 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTNP21246 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTNP21246 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTNP21246 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTNP21246 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTNP21246 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTNP21246 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTNP21246 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTNP21246 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTNP21246 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTNP21246 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTNP21246 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTNP21246 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTNP21246 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTNP21246 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTNP21246 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTNP21246 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTNP21246 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTNP21246 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTNP21246 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTNP21246 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTNP21246 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTNP21246 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTNP21246 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTNP21246 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTNP21246 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTNP21246 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms