Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCP20941 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCP20941 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCP20941 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCP20941 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCP20941 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDCP20941 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCP20941 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCP20941 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCP20941 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCP20941 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCP20941 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCP20941 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCP20941 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCP20941 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCP20941 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCP20941 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCP20941 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCP20941 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCP20941 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCP20941 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDCP20941 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCP20941 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCP20941 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCP20941 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCP20941 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCP20941 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCP20941 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCP20941 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCP20941 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCP20941 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCP20941 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCP20941 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCP20941 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCP20941 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCP20941 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCP20941 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCP20941 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDCP20941 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDCP20941 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDCP20941 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCP20941 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCP20941 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCP20941 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCP20941 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCP20941 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCP20941 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCP20941 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCP20941 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCP20941 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDCP20941 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCP20941 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCP20941 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCP20941 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCP20941 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCP20941 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCP20941 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCP20941 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCP20941 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCP20941 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCP20941 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCP20941 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCP20941 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCP20941 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCP20941 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCP20941 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCP20941 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCP20941 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCP20941 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCP20941 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCP20941 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCP20941 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDCP20941 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCP20941 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCP20941 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCP20941 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCP20941 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCP20941 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCP20941 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCP20941 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCP20941 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCP20941 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCP20941 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCP20941 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCP20941 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCP20941 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCP20941 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCP20941 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCP20941 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCP20941 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDCP20941 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCP20941 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCP20941 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCP20941 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCP20941 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCP20941 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCP20941 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCP20941 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCP20941 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDCP20941 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms