Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EFNA1P20827 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EFNA1P20827 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms