Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EGR1P18146 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EGR1P18146 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
EGR1P18146 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EGR1P18146 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
EGR1P18146 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EGR1P18146 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EGR1P18146 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EGR1P18146 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EGR1P18146 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EGR1P18146 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EGR1P18146 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
EGR1P18146 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EGR1P18146 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EGR1P18146 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EGR1P18146 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EGR1P18146 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EGR1P18146 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EGR1P18146 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
EGR1P18146 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
EGR1P18146 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
EGR1P18146 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EGR1P18146 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EGR1P18146 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EGR1P18146 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
EGR1P18146 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EGR1P18146 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EGR1P18146 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EGR1P18146 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EGR1P18146 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EGR1P18146 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EGR1P18146 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EGR1P18146 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EGR1P18146 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EGR1P18146 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EGR1P18146 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EGR1P18146 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EGR1P18146 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EGR1P18146 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EGR1P18146 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EGR1P18146 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EGR1P18146 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EGR1P18146 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EGR1P18146 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EGR1P18146 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
EGR1P18146 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EGR1P18146 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EGR1P18146 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
EGR1P18146 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR1P18146 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR1P18146 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR1P18146 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR1P18146 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR1P18146 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR1P18146 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR1P18146 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR1P18146 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR1P18146 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR1P18146 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR1P18146 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR1P18146 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR1P18146 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR1P18146 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR1P18146 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR1P18146 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR1P18146 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR1P18146 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR1P18146 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR1P18146 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR1P18146 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR1P18146 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR1P18146 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR1P18146 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR1P18146 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EGR1P18146 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR1P18146 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR1P18146 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR1P18146 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR1P18146 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR1P18146 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR1P18146 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR1P18146 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR1P18146 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR1P18146 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR1P18146 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR1P18146 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR1P18146 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR1P18146 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR1P18146 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR1P18146 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR1P18146 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR1P18146 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR1P18146 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR1P18146 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR1P18146 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR1P18146 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR1P18146 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EGR1P18146 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR1P18146 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EGR1P18146 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms