Protein–RNA interactions for Protein: P17677

GAP43, Neuromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAP43P17677 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAP43P17677 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAP43P17677 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAP43P17677 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAP43P17677 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAP43P17677 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAP43P17677 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAP43P17677 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAP43P17677 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GAP43P17677 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAP43P17677 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAP43P17677 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAP43P17677 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAP43P17677 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAP43P17677 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAP43P17677 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAP43P17677 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAP43P17677 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GAP43P17677 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAP43P17677 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAP43P17677 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAP43P17677 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAP43P17677 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAP43P17677 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAP43P17677 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAP43P17677 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAP43P17677 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAP43P17677 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAP43P17677 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAP43P17677 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAP43P17677 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAP43P17677 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAP43P17677 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAP43P17677 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAP43P17677 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAP43P17677 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAP43P17677 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAP43P17677 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAP43P17677 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAP43P17677 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAP43P17677 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAP43P17677 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAP43P17677 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAP43P17677 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAP43P17677 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAP43P17677 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAP43P17677 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GAP43P17677 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GAP43P17677 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAP43P17677 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAP43P17677 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAP43P17677 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAP43P17677 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAP43P17677 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAP43P17677 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAP43P17677 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAP43P17677 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GAP43P17677 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAP43P17677 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAP43P17677 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAP43P17677 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAP43P17677 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GAP43P17677 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAP43P17677 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAP43P17677 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAP43P17677 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAP43P17677 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GAP43P17677 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAP43P17677 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAP43P17677 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAP43P17677 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAP43P17677 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAP43P17677 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAP43P17677 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAP43P17677 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAP43P17677 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAP43P17677 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAP43P17677 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAP43P17677 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAP43P17677 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAP43P17677 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GAP43P17677 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAP43P17677 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAP43P17677 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAP43P17677 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAP43P17677 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAP43P17677 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAP43P17677 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAP43P17677 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GAP43P17677 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAP43P17677 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAP43P17677 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAP43P17677 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GAP43P17677 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAP43P17677 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAP43P17677 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAP43P17677 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GAP43P17677 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GAP43P17677 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GAP43P17677 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms