Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA1P17302 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA1P17302 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA1P17302 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA1P17302 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA1P17302 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GJA1P17302 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA1P17302 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA1P17302 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA1P17302 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA1P17302 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA1P17302 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA1P17302 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA1P17302 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA1P17302 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA1P17302 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA1P17302 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA1P17302 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA1P17302 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA1P17302 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA1P17302 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA1P17302 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA1P17302 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA1P17302 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA1P17302 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA1P17302 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA1P17302 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA1P17302 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA1P17302 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA1P17302 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA1P17302 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA1P17302 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA1P17302 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GJA1P17302 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA1P17302 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA1P17302 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA1P17302 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA1P17302 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA1P17302 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA1P17302 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA1P17302 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA1P17302 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA1P17302 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA1P17302 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA1P17302 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA1P17302 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA1P17302 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA1P17302 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA1P17302 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA1P17302 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GJA1P17302 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA1P17302 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA1P17302 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA1P17302 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA1P17302 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA1P17302 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA1P17302 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA1P17302 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA1P17302 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA1P17302 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA1P17302 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA1P17302 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA1P17302 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA1P17302 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA1P17302 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA1P17302 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA1P17302 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA1P17302 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GJA1P17302 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GJA1P17302 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA1P17302 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA1P17302 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA1P17302 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA1P17302 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA1P17302 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA1P17302 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA1P17302 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA1P17302 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA1P17302 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA1P17302 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA1P17302 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA1P17302 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA1P17302 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA1P17302 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA1P17302 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA1P17302 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GJA1P17302 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA1P17302 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA1P17302 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA1P17302 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA1P17302 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA1P17302 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA1P17302 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA1P17302 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA1P17302 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA1P17302 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA1P17302 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA1P17302 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA1P17302 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GJA1P17302 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms