Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME1P15531 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME1P15531 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME1P15531 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NME1P15531 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME1P15531 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME1P15531 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME1P15531 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME1P15531 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME1P15531 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME1P15531 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME1P15531 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME1P15531 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME1P15531 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME1P15531 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NME1P15531 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME1P15531 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME1P15531 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME1P15531 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME1P15531 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME1P15531 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NME1P15531 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME1P15531 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME1P15531 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME1P15531 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME1P15531 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME1P15531 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME1P15531 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME1P15531 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME1P15531 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME1P15531 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME1P15531 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME1P15531 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NME1P15531 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME1P15531 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME1P15531 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME1P15531 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME1P15531 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME1P15531 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NME1P15531 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NME1P15531 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME1P15531 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME1P15531 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME1P15531 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME1P15531 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME1P15531 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME1P15531 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME1P15531 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME1P15531 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME1P15531 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NME1P15531 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME1P15531 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME1P15531 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME1P15531 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME1P15531 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME1P15531 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NME1P15531 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME1P15531 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NME1P15531 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME1P15531 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME1P15531 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME1P15531 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME1P15531 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME1P15531 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME1P15531 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME1P15531 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME1P15531 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME1P15531 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NME1P15531 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME1P15531 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME1P15531 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME1P15531 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME1P15531 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME1P15531 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME1P15531 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME1P15531 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME1P15531 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME1P15531 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME1P15531 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME1P15531 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME1P15531 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NME1P15531 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME1P15531 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME1P15531 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME1P15531 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME1P15531 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME1P15531 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME1P15531 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME1P15531 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NME1P15531 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME1P15531 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME1P15531 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME1P15531 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME1P15531 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME1P15531 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME1P15531 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME1P15531 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME1P15531 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NME1P15531 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NME1P15531 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms